Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc174Q3U155 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc174Q3U155 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms