Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hhla1Q3TYV2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hhla1Q3TYV2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms