Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srsf6Q3TWW8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms