Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms