Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms