Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms