Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl2bQ3TD49 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl2bQ3TD49 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms