Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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