Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colec11Q3SXB8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms