Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lemd1Q14C37 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lemd1Q14C37 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms