Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc39dQ0VF76 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc39dQ0VF76 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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