Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms