Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spata18Q0P557 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms