Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MitfQ08874 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms