Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc4Q08624 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms