Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col9a2Q07643 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms