Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms