Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox12Q04890 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms