Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox9Q04887 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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