Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms