Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms