Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hivep1Q03172 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hivep1Q03172 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hivep1Q03172 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms