Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms