Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms