Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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