Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms