Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms