Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec23aQ01405 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms