Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms