Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms