Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2bQ01097 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms