Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms