Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms