Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms