Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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