Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp9bP98195 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp9bP98195 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms