Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms