Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms