Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms