Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gbx1P82976 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gbx1P82976 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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