Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms