Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms