Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tp53bp1P70399 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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