Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp9xP70398 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp9xP70398 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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