Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SeboxP70368 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SeboxP70368 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SeboxP70368 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms