Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms