Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms