Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms