Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms