Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gnb1P62874 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gnb1P62874 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms